1. Если можно разгуляться по бюджету, то Орловский тоннель, если надо подешевле, то Арсенальный мост. Смысл - восполнить дефицит мостов через Неву там, где их меньше всего.
Строящиеся развязки (на Черной речке, например) не называть.
Как я понимаю, их для целей анкеты можно считать уже построенными и, соответствующим образом влияющими на траффик?!
2. Простые путепроводы:
1) продолжение проспекта Маршала Блюхера до Индустриального (по сути просто путепровод с подходами);
2) путепровод в створе улицы Черняховского, точнее, я бы его на в створ Днепропетровской улицы вывел.
3. Западная транзитная магистраль: Стародеревенская набережная - тоннель на полуостров Безымянный - набережная Мартынова - Константиновский проспект - Песочный мост в створе улицы Профессора Попова.
4. Подземные пешеходные переходы:
1) пол площадью Александра Невского;
2) под площадью Восстания.
5. Набережная Лиговского канала примерно по его старинному руслу от пл. Московские Ворота до Краснопутиловской улицы и проспекта Народного Ополчения.
Возможно не совсем учёл южные потребности, но, извините, автор темы очень жёсткие условия поставил, а проблемных районов очень много, так я хоть как-то весь север и центр сумел объять.